Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE3BQ13370 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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