Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms