Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms