Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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FMODQ06828 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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FMODQ06828 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FMODQ06828 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FMODQ06828 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FMODQ06828 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FMODQ06828 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FMODQ06828 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FMODQ06828 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FMODQ06828 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FMODQ06828 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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