Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H3F3AP84243 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H3F3AP84243 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms