Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms