Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms