Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms