Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLDN17P56750 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLDN17P56750 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLDN17P56750 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLDN17P56750 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLDN17P56750 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLDN17P56750 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLDN17P56750 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLDN17P56750 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN17P56750 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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