Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms