Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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