Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DAP3P51398 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms