Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB2P47870 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms