Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD4P46934 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms