Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RECQLP46063 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RECQLP46063 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms