Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BMI1P35226 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms