Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms