Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms