Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms