Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms