Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTAFRP25105 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms