Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms