Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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