Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms