Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms