Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF3P15923 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF3P15923 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms