Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FARP2O94887 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FARP2O94887 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FARP2O94887 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARP2O94887 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARP2O94887 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms