Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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