Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms