Protein–RNA interactions for Protein: O15145

ARPC3, Actin-related protein 2/3 complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC3O15145 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ARPC3O15145 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms