Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP17L13C9JLJ4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms