Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms