Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms