Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms