Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms