Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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