Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC7AQ9ULT0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms