Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms