Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRBP1Q9P2E9 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms