Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms