Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC17Q9NP64 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms