Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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