Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms