Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NDFIP1Q9BT67 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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