Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 713.7 ms