Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMIEQ8NEW7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMIEQ8NEW7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMIEQ8NEW7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TMIEQ8NEW7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TMIEQ8NEW7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TMIEQ8NEW7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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