Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms