Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PHF13Q86YI8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF13Q86YI8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms