Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECW1Q76N89 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms