Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms